进一步地降低儒生们对科学的警惕心理。
孔子诛少正卯这事徐光启自然是知道的，稍微想了想他就明白了皇帝的意思，孔圣人那是在消灭异端，他想不明白的是朱皇帝这是要阻止西学对儒学的影响渗透以维护理学的正统地位，还是单纯地要保护他们这批西学爱好者。
徐光启只是个比较纯粹的学者型官僚，揣摩上意方面显然不是他的强项，稍微想了想就放弃了，“皇上所言极是。”
接下来，朱皇帝就开始交代徐光启第一步该怎么做事。
要推动广义的物理学也即是自然科学的进步，首要要解决的问题，自然是思想层面的。朱皇帝很清楚，单纯的科学理论有不适用的时候，比如经典力学理论模型中的一些定量在广义相对论和量子力学的研究领域里就是变量，而科学真正永恒的东西只有其思想和方法。他也不准备一开始就拿出正确的理论，他也明白一个重要的事实，存在一个一贯正确的权威，对需要怀疑精神的科学发展来说绝对不是好事。
对如何打牢科学大厦的地基这个问题，朱皇帝的规划很明确。先拿出现有的西方科学著作，引导这些对科学感兴趣的儒生们用实验去推翻其中的谬误，配合逻辑学的推广，帮助他们掌握科学的方法论。
古代中国有着比较发达的技术，却没有产生科学思想，原因是多方面的，作为科学思想基础之一的逻辑学研究方面的缺失，显然是重要原因之一。来到这个世界之后，他也有自己写一本逻辑学著作的打算，只是以
6.科学思想(5/6)