期，由炮科和工科的学生组炮兵团，工兵营和迫击炮营随军参加战斗，在湘、赣、鄂等省战役立下战功；科学生也沿途投入宣传和战斗。而留守后方的步科，经理科学生，则担任本校守卫和分防各地的勤务，卫戍地方治安等任务。1927年4月后，国共两党公开分裂和武汉与南京两地政的对峙，双方斗争烈。不少在校的五期学生xx和逃散。故入校学生与毕业学生人数对比相差达800余人。
二、南京时期
第六期
本期学生，有黄埔本校和南京本校之分。两者情况各有不同：黄埔六期，先是李济深于1928年5月以中央会广州分会名义将本校改名国民xx军军官学校。学生原在1926年10月正式入学，学习科目有步、炮、工、经理四科，计入伍生达4400余人。其学生来源广及缅甸、越南、朝鲜、南洋群岛等地。但这六期学生与五期学生一样，亦因国共分裂与斗争和地方势力的破坏，使学生星散特多，留在黄埔本校的学生至1929年2月毕业者仅718人。为与南京本校六期一总队有别，该期称黄埔六期二总队。
南京六期，1927年底，在南京原拟筹备立中央军事学校，至1928年3月再改名为中央陆军军官学校，作黄埔本校的延续。而将原黄埔本校学生改作南京本校的预科生。首批学生是来源于黄埔本校招收的第六期入伍生。他们因国共分裂使学校一度陷于停顿而分散各地。至1928年初，陆续应南京本校和同学会之召而陆续到杭州集中受训，计有
黄埔（二）(20/33)