父子的“政见”，在海外引起反响，蒋介石更是愤怒。蒋氏父子操纵的舆论与吴大打“口水战”，搞得蒋氏父子十分难堪。国民党中央通过决议开除吴国桢党籍。蒋介石发布“总统命令”，称吴“背叛国家污蔑政府，妄图分化国军，离间人民与政府及侨胞与祖国之关系，居心叵测，罪迹显著”。后来还要求美国“引渡”吴回台受审，这一要求被美国方面拒绝。
3．编织罪名，剪除“功高震主”者。
吴国桢事件尚未了结，蒋氏父子又制造了“孙立人案”。
孙立人早年曾留学美国印第安纳州的普度大学，后转入西点军校，回国后，在党务党校任军训队长，1940年任师长，随后率部参加远征军赴缅甸作战。曾在仁安羌解救被围英军，反攻緬北时又立战功，被誉为“东方的隆美尔”，获英国皇家勋章。在蒋介石与史迪威的争斗中，他坚决支持蒋。因此，虽然非黄埔嫡系，仍深得老蒋的信任。抗战胜利后，特别是在蒋介石发动全面内战后，孙被任重要的军事职务。退台后，老蒋任命孙为“陆军总司令兼台湾防卫司令”。
在台湾，军权在握的孙立人自恃有功，又是“美军的宠儿”，“委员长的爱将”，除了蒋介石外不把任何人放在眼里，小蒋也不例外。蒋经国在部队中建立“政工制度”时，加强特务统治，以控制军队，孙立人对这种做法极为反感。曾联合美国军事顾问团团长蔡斯进行抵制。这样，就给了蒋介石的口实。
在查办吴国桢之后的三个月，下令免去了
62、果断清障，为权力让渡开道(5/8)