左宗棠则是老谋深算的军事家。他针对西北地区的地理特点制定了正确的作战方针，完成对金积堡的包围以后成功地使用深沟高垒阻断了起义军的内突外援，迫使处在绝境中的起义军只有投降了。
清军的胜利也是付出了重大代价的，仅刘松山的老湘军死伤官兵达千余人，因伤致残达2000余人。左宗棠也承认十多年来手下的伤亡也没有超过这一次，可见清军的损失非常严重。
马化龙领导的金积堡起义是历史上规模最大的一次哲合忍耶教派起义，因此引起了朝廷对哲合忍耶的高度关注，掀起了大肆镇压新教的活动。
左宗棠在发布的布告中说道：“查新教本是回教异端，自乾隆四十六年剿办马明心、苏四十三，四十九年办田逆后，马化龙之父马二，复以新教遗种，惑众敛钱，传染数省。马化龙凶焰更炽”，今后“如敢仍行新教，听从海里飞等妖徒惑众，潜相勾煽，或妄造谣言……定即立定刑诛”。
于是，朝廷采取了打散教民和减弱势力的策略，把哲合忍耶教民强行安置在隔绝的荒地上。
哲合忍耶教民为了纪念马化龙殉难，尊称他为十三太爷，在吴忠设立拱北纪念。哲合忍耶第七代穆勒师德马元章用重金买回了马化龙的头颅，埋在张家川的北山拱北（坟地）。
马化龙的男性后裔几乎都被杀害，仅留下了两个孙子:一个6岁的马进成，一个4岁的马进西。
1877年4月，官府把马进成阉割以后送给开封的官吏温某为
第五十七章 陇上风云(8/9)